La función del sistema inmune es mantener la individualidad biológica, por ello, su principal actividad es diferenciar y eliminar todo material extraño de sus tejidos.

Los camarones, como el resto de los crustáceos y a diferencia de los vertebrados, no poseen órganos inmunitarios, ni presentan inmunidad adquirida, ni memoria inmunológica.

Por lo que, como que no tienen una respuesta inmune específica contra agentes infecciosos, han desarrollado un complejo, eficiente y altamente desarrollado sistema defensivo inespecífico (inmunidad innata) constituida por:

• Barreras Físicas => exoesqueleto que lo recubre externamente y membrana peritrófica que envuelve el bolo alimenticio para proteger el epitelio del sistema digestivo.
• Respuesta Activa => constituida por mecanismos hemostáticos, respuesta celular y humoral.

La respuesta celular esta mediada por los hemocitos (células inmunoactivas circulantes), poseen capacidad citotóxica y comunicación intercelular que les facilita las funciones de coagulación, reconocimiento, fagocitosis, melanización, formación de nódulos y encapsulación.

La respuesta humoral incluye varios componentes plasmáticos (péptidos antimicrobianos, histonas, enzimas lisosomales, lipopolisacáridos, proteínas de reconocimiento a glucanos), el sistema profenoloxidasa, y la cascada de coagulación que favorece la destrucción de los patógenos

Las reacciones inmunológicas son activadas por moléculas asociadas al patógeno, por ejemplo, LPS y péptidoglicanos bacterianos, beta-glucanos de hongos y RNA de doble cadena de los virus. La subsecuente respuesta es mediada por los mecanismos celulares y humorales, que actúan de forma integrada, protegiéndolos contra la invasión de microorganismos y parásitos, garantizando así su integridad corporal y homeostática.

Aunque no existe homología con el sistema inmune adquirido de los vertebrados, parece que el sistema inmune celular en estos organismos tiene una memoria de corto plazo.